Desde 1994, as atividades ligadas à Climatologia Aeronáutica são realizadas no Instituto de Controle do Espaço Aéreo, embora alguns de seus trabalhos sejam desenvolvidos em parceria com a Divisão de Ciências Atmosféricas (ACA), do Instituto de Aeronáutica e Espaço (IAE), localizado no Departamento de Ciência e Tecnologia Aeroespacial (DCTA).
          A Climatologia Aeronáutica do ICEA, durante este período, realizou diversos estudos climatológicos, atendendo às solicitações de vários órgãos do Comando da Aeronáutica. Além disso, nesse período, grande avanço foi dado no desenvolvimento do Banco de Dados Climatológicos (BDC), causando um acréscimo significativo nas atribuições e no volume de atividades desenvolvidas.
          Atualmente, a Climatologia Aeronáutica é constituida por três seções, contando com um efetivo de quatorze militares, sendo dois oficiais e doze graduados.